Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHMBP2P38935 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IGHMBP2P38935 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGHMBP2P38935 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGHMBP2P38935 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGHMBP2P38935 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGHMBP2P38935 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGHMBP2P38935 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGHMBP2P38935 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms