Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	RCK2	YLR248W	1833 nt		4.78	□□□□□ -1.64
YBR053C	P38235	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.78	□□□□□ -1.64
YBR053C	P38235	YIG1	YPL201C	1386 nt		4.78	□□□□□ -1.64
YBR053C	P38235	SIS2	YKR072C	1689 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MAG2	YLR427W	2013 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	RAD53	YPL153C	2466 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YAP6	YDR259C	1152 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YMR085W	YMR085W	1299 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	TPP1	YMR156C	717 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MDY2	YOL111C	639 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	FRE3	YOR381W	2136 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	SUR1	YPL057C	1149 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YCL012C	YCL012C	405 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MPP10	YJR002W	1782 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	TDA6	YPR157W	1404 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	GGA1	YDR358W	1674 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YNR066C	YNR066C	1311 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	PMA1	YGL008C	2757 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	TYW3	YGL050W	822 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	RPC34	YNR003C	954 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YNR061C	YNR061C	660 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MAK3	YPR051W	531 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	FRS1	YLR060W	1788 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YEH2	YLR020C	1617 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	SIP5	YMR140W	1470 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	TUB3	YML124C	1338 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YCR108C	YCR108C	192 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	PET100	YDR079W	336 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	RPL12A	YEL054C	498 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	RPL27A	YHR010W	411 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	FIG1	YBR040W	897 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YBR219C	YBR219C	384 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	STR2	YJR130C	1920 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	RBA50	YDR527W	1320 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	TAF8	YML114C	1533 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ALD3	YMR169C	1521 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ALD2	YMR170C	1521 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	SNU23	YDL098C	585 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ARF2	YDL137W	546 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	SPT3	YDR392W	1014 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	OST5	YGL226C-A	261 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	PRP18	YGR006W	756 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	APQ13	YJL075C	417 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	SEC14	YMR079W	915 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	VPS21	YOR089C	633 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ECM23	YPL021W	564 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ATG5	YPL149W	885 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	CBF5	YLR175W	1452 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MOT2	YER068W	1764 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MEC3	YLR288C	1425 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	NOP58	YOR310C	1536 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	TRE2	YOR256C	2430 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MIC60	YKR016W	1623 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	VAN1	YML115C	1608 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	NPL4	YBR170C	1743 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	LHP1	YDL051W	828 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YDR203W	YDR203W	318 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	SPR6	YER115C	576 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	NRK1	YNL129W	723 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	GAL7	YBR018C	1101 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	CMR3	YPR013C	954 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	BMT2	YBR141C	1014 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	SSB2	YNL209W	1842 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YMR111C	YMR111C	1389 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MAL12	YGR292W	1755 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MAL32	YBR299W	1755 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	FOL2	YGR267C	732 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YIL025C	YIL025C	375 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	GLG2	YJL137C	1143 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	MAP2	YBL091C	1266 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	CIN5	YOR028C	888 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ENV9	YOR246C	993 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YOR314W	YOR314W	330 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	PDX3	YBR035C	687 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ECM33	YBR078W	1290 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	CDC28	YBR160W	897 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YHR182W	YHR182W	2358 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	ERG4	YGL012W	1422 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YBR053C	P38235	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	BI2	Q0110	1272 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	YER187W	YER187W	426 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	UPS2	YLR168C	693 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	RMI1	YPL024W	726 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	URK1	YNR012W	1506 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	WTM2	YOR229W	1404 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	MSA1	YOR066W	1890 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YBR053C	P38235	POL31	YJR006W	1464 nt		4.7	□□□□□ -1.66

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