Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SREBF1P36956 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms