Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBRP36941 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBRP36941 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBRP36941 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBRP36941 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBRP36941 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBRP36941 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBRP36941 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBRP36941 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBRP36941 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBRP36941 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBRP36941 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBRP36941 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBRP36941 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBRP36941 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBRP36941 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBRP36941 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms