Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL4P36578 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL4P36578 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL4P36578 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL4P36578 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL4P36578 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL4P36578 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL4P36578 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL4P36578 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL4P36578 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL4P36578 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL4P36578 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms