Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT9P35527 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT9P35527 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT9P35527 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT9P35527 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT9P35527 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT9P35527 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT9P35527 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT9P35527 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT9P35527 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT9P35527 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT9P35527 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT9P35527 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT9P35527 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT9P35527 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT9P35527 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT9P35527 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT9P35527 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT9P35527 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT9P35527 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT9P35527 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT9P35527 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT9P35527 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT9P35527 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT9P35527 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT9P35527 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT9P35527 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT9P35527 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT9P35527 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT9P35527 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT9P35527 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT9P35527 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT9P35527 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT9P35527 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT9P35527 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT9P35527 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT9P35527 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT9P35527 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms