Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPN7P35236 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms