Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCGF2P35227 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF2P35227 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms