Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC1P33527 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ABCC1P33527 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC1P33527 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms