Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP2P32456 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP2P32456 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP2P32456 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP2P32456 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP2P32456 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBP2P32456 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms