Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC3AP31941 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms