Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HTR2AP28223 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms