Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPA1P27694 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPA1P27694 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPA1P27694 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA1P27694 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA1P27694 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA1P27694 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA1P27694 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA1P27694 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPA1P27694 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA1P27694 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA1P27694 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPA1P27694 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA1P27694 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA1P27694 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA1P27694 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA1P27694 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA1P27694 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA1P27694 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA1P27694 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA1P27694 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms