Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BCKDHBP21953 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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