Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDSP20132 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDSP20132 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDSP20132 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDSP20132 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDSP20132 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDSP20132 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDSP20132 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDSP20132 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDSP20132 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDSP20132 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDSP20132 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SDSP20132 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SDSP20132 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDSP20132 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDSP20132 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SDSP20132 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDSP20132 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDSP20132 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDSP20132 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms