Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD58P19256 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD58P19256 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD58P19256 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD58P19256 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD58P19256 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD58P19256 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD58P19256 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD58P19256 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD58P19256 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD58P19256 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms