Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCC1P18754 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCC1P18754 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCC1P18754 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCC1P18754 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCC1P18754 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCC1P18754 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCC1P18754 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms