Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHCEP18577 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHCEP18577 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHCEP18577 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHCEP18577 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHCEP18577 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHCEP18577 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHCEP18577 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHCEP18577 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms