Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPI1P17947 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPI1P17947 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPI1P17947 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPI1P17947 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPI1P17947 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPI1P17947 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPI1P17947 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPI1P17947 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPI1P17947 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPI1P17947 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPI1P17947 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPI1P17947 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPI1P17947 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms