Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DESP17661 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DESP17661 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DESP17661 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DESP17661 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DESP17661 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DESP17661 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DESP17661 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms