Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXB9P17482 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXB9P17482 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXB9P17482 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXB9P17482 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXB9P17482 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB9P17482 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms