Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKCAP17252 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCAP17252 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms