Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRAFP15056 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRAFP15056 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRAFP15056 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAFP15056 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAFP15056 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRAFP15056 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRAFP15056 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRAFP15056 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRAFP15056 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRAFP15056 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms