Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCG2P13521 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCG2P13521 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCG2P13521 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCG2P13521 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCG2P13521 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG2P13521 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG2P13521 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG2P13521 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG2P13521 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCG2P13521 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG2P13521 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG2P13521 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG2P13521 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG2P13521 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG2P13521 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG2P13521 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCG2P13521 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCG2P13521 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCG2P13521 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCG2P13521 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms