Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD8P13378 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms