Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL6A2P12110 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL6A2P12110 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms