Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD28P10747 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD28P10747 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD28P10747 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD28P10747 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD28P10747 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD28P10747 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD28P10747 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD28P10747 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD28P10747 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD28P10747 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD28P10747 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD28P10747 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD28P10747 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD28P10747 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD28P10747 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD28P10747 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms