Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VSIG8P0DPA2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VSIG8P0DPA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms