Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM200BP0CF97 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM200BP0CF97 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms