Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00869P0C866 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00869P0C866 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms