Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C4BP0C0L5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms