Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT19P08727 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT19P08727 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT19P08727 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT19P08727 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT19P08727 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT19P08727 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT19P08727 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT19P08727 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT19P08727 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT19P08727 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT19P08727 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT19P08727 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT19P08727 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT19P08727 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT19P08727 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT19P08727 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT19P08727 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms