Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPRAP08240 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPRAP08240 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPRAP08240 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms