Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGAVP06756 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms