Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms