Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNB1P01574 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNB1P01574 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms