Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASS1P00966 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASS1P00966 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASS1P00966 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASS1P00966 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASS1P00966 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASS1P00966 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASS1P00966 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASS1P00966 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASS1P00966 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASS1P00966 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASS1P00966 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASS1P00966 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ASS1P00966 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASS1P00966 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASS1P00966 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASS1P00966 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASS1P00966 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASS1P00966 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ASS1P00966 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASS1P00966 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASS1P00966 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASS1P00966 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASS1P00966 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASS1P00966 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASS1P00966 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASS1P00966 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASS1P00966 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASS1P00966 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASS1P00966 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ASS1P00966 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASS1P00966 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASS1P00966 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASS1P00966 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASS1P00966 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms