Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TBX18O95935 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBX18O95935 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBX18O95935 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBX18O95935 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TBX18O95935 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBX18O95935 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBX18O95935 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TBX18O95935 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBX18O95935 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBX18O95935 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms