Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX6O95503 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX6O95503 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX6O95503 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX6O95503 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX6O95503 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.1 ms