Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX3O95343 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX3O95343 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX3O95343 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX3O95343 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX3O95343 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX3O95343 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX3O95343 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX3O95343 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX3O95343 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX3O95343 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX3O95343 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX3O95343 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms