Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFASCO94856 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFASCO94856 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFASCO94856 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFASCO94856 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFASCO94856 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFASCO94856 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFASCO94856 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFASCO94856 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFASCO94856 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFASCO94856 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFASCO94856 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFASCO94856 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFASCO94856 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFASCO94856 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFASCO94856 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFASCO94856 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFASCO94856 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFASCO94856 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFASCO94856 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFASCO94856 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFASCO94856 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFASCO94856 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms