Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ECM2O94769 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM2O94769 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM2O94769 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM2O94769 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM2O94769 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM2O94769 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM2O94769 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM2O94769 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM2O94769 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM2O94769 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM2O94769 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM2O94769 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM2O94769 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM2O94769 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM2O94769 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms