Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGR5O75473 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGR5O75473 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LGR5O75473 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGR5O75473 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGR5O75473 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR5O75473 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR5O75473 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGR5O75473 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGR5O75473 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGR5O75473 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms