Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAMP4O75379 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAMP4O75379 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms