Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUTAO60888 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUTAO60888 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUTAO60888 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUTAO60888 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUTAO60888 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUTAO60888 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUTAO60888 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUTAO60888 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUTAO60888 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUTAO60888 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUTAO60888 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUTAO60888 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUTAO60888 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUTAO60888 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUTAO60888 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUTAO60888 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms