Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms