Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK2O43639 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK2O43639 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK2O43639 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK2O43639 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK2O43639 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK2O43639 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCK2O43639 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCK2O43639 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCK2O43639 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCK2O43639 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCK2O43639 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK2O43639 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK2O43639 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK2O43639 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK2O43639 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK2O43639 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCK2O43639 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCK2O43639 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK2O43639 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK2O43639 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK2O43639 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK2O43639 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK2O43639 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK2O43639 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCK2O43639 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCK2O43639 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms