Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNQ3O43525 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ3O43525 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ3O43525 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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