Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COCHO43405 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COCHO43405 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COCHO43405 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COCHO43405 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COCHO43405 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COCHO43405 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COCHO43405 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COCHO43405 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COCHO43405 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COCHO43405 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms