Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCAO15360 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCAO15360 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCAO15360 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCAO15360 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCAO15360 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCAO15360 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCAO15360 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCAO15360 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCAO15360 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
FANCAO15360 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FANCAO15360 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FANCAO15360 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FANCAO15360 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FANCAO15360 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FANCAO15360 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FANCAO15360 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCAO15360 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCAO15360 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCAO15360 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCAO15360 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCAO15360 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FANCAO15360 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FANCAO15360 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FANCAO15360 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
FANCAO15360 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCAO15360 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCAO15360 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCAO15360 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCAO15360 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FANCAO15360 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FANCAO15360 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCAO15360 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCAO15360 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCAO15360 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCAO15360 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCAO15360 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
FANCAO15360 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FANCAO15360 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FANCAO15360 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FANCAO15360 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCAO15360 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCAO15360 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCAO15360 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCAO15360 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCAO15360 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FANCAO15360 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCAO15360 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCAO15360 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCAO15360 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCAO15360 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCAO15360 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCAO15360 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FANCAO15360 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCAO15360 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCAO15360 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCAO15360 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCAO15360 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCAO15360 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCAO15360 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FANCAO15360 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCAO15360 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCAO15360 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCAO15360 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCAO15360 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCAO15360 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms